16S 測序研究小鼠肺癌免疫相關微生物

2015-12-18    編輯:諾禾致源
研究小鼠肺癌免疫相關微生物背景圖

研究背景

245棋牌共生菌作為與生物體共存的“免疫器官“,在維持機體粘膜免疫穩態過程中發揮著極其重要的作用,與多種重大疾病的發生發展關系密切。作為先天和后天免疫系統的橋梁,近年來,越來越多的研究表明γδT17細胞對包括傳染性、自身免疫性以及炎癥性疾病等在內的諸多疾病均有重要作用。已有研究表明,缺失共生菌的無菌小鼠會出現免疫系統的缺陷,但共生菌在肺粘膜腫瘤免疫監督形成方面的作用還未見報道。

方法流程

樣品取材

1. 4至5周大的C57BL/6雌鼠
2. 抗生素處理(Abt)實驗組小鼠的水中加

入氨芐青霉素、萬古霉素、硫酸新霉素、甲硝銼

文庫類型

0.18-0.22g糞便樣品提取總DNA
245棋牌 16S V4區PCR擴增

測序策略

Illumina MiSeq PE250

主要分析

OTU聚類和分析
α-多樣性分析
β-多樣性分析

研究結果

245棋牌1、抗生素處理導致小鼠糞便中細菌物種組成發生改變,其中厚壁菌門和擬桿菌門的豐度降低,變形菌門豐度升高(圖1)。

2、抗生素處理組的小鼠糞便中未發現新的耐抗生素的菌株,因此宿主依賴于共生細菌的防御機制不具有物種特異性。

3、在抗生素處理的小鼠中,肺臟腫瘤易感性與肺臟γδT17細胞功能顯著降低密切相關;菌群缺失可導致肺臟組織中IL-6、IL-23等關鍵細胞因子水平顯著降低,這也被認為是影響肺臟γδT17細胞功能的重要因素(圖2)。

四種抗生素處理后小鼠腸道菌群結構的變化

圖1   四種抗生素處理后小鼠腸道菌群結構的變化

Abt小鼠更易患肺癌的易感性分析

圖2   Abt小鼠更易患肺癌的易感性分析

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