ctDNA揭秘體內腫瘤突變信息

2017-01-17    編輯:諾禾致源
ctDNA

245棋牌 講解ctDNA之前,先了解一下cfDNA的定義,cfDNA(cell free DNA),是血漿中游離存在的DNA,有的來自正常細胞,有的來自異常細胞(如腫瘤細胞);而ctDNA是由腫瘤細胞釋放到血漿中的單鏈或者雙鏈DNA,攜帶有與原發腫瘤組織相一致的分子遺傳學突變,通過檢測ctDNA的基因突變,就可以揭秘體內腫瘤組織的突變信息,因此ctDNA可應用于腫瘤的早期診斷、動態監測腫瘤的發生發展及療效、耐藥檢測、復發風險評估等,在腫瘤診治中前景廣闊。


ctDNA是cfDNA的一部分,而且ctDNA含量低(<1.0%總cfDNA),片段短(180-200bp),半衰期短(約2小時),這就使得從血漿DNA中單純分離出ctDNA非常困難,而新一代測序(NGS)技術,可以測出所有cfDNA信息,利用腫瘤細胞基因組的特點,從攜帶信息的層面去挑出屬于腫瘤細胞的部分,根據突變信息來確定下一步的診療方案,不用再在分子層面去分離ctDNA。


ctDNA文庫構建

ctDNA 文章

今年8月份奧地利科學家在《Nature Genetics》發表的關于cfDNA的研究結果表明,cfDNA能夠輔助預測基因表達,可以檢測出患者的癌癥驅動基因。根據cfDNA的讀取深度模式來預測活性或非活性轉錄起始位點上游的核小體的表達差異。研究者利用100多名健康個體的血液樣本建立了這種方法,并將其應用在400多名癌癥患者的樣本上,結果顯示這種方法適合檢測影響癌癥驅動基因的擴增,檢測腫瘤的動態情況。